1949年新中國成立後,澳葡政府與中國之間仍見邊界衝突,如1952年的“關閘事件”,雙方一度武力對峙。另一個重大事件是1966年的“一二.三事件”,在殖民政府腐敗的管治下,華人與葡萄牙人社群的磨擦不斷增加,引發了澳門史上最嚴重的警民衝突,造成大批平民傷亡,在中國政府的抗議下,澳葡政府最終道歉和賠款。“一二.三事件”除了打擊澳葡政府的威信之外,也把右派勢力逐出澳門。
1974年,葡萄牙發生“康乃馨革命”,新政府放棄殖民主義,承認澳門為中國領土,並撤走軍隊。至1980年代,中國與葡萄牙就澳門的前途問題進行談判,並於1987年簽訂《中葡聯合聲明》。在過渡期間,澳門繼續由澳葡政府管治,並為回歸後政治制度進行整理以便過渡。
1960年代,澳葡政府積極發展本地的旅遊業及博彩業;在70年代,本地的輕工業發展催向成熟,至80年代成為澳門工業的黃金時期。與此同時,澳葡政府在70至90年代對新口岸、黑沙環和氹仔進行開發,而澳氹大橋、友誼大橋和澳門機場等機建也在此時落成使用。