清道光九年（1829年2月4日─1830年1月24日）本年，媽閣廟重修完工。此次重修，由媽閣廟執事趙允菁、謝懷德、林欽懷等30人發起，得到廣東水師提督李增楷、香山協鎮將徐世雄、澳門同知鹿亢宗、香山知縣劉開域及粵海關澳門總口、各稅口省城謝東裕行、伍治光堂、潘同孚行等官商支持。合共收到捐銀7000餘兩。其中，澳門士商捐銀3674兩8錢3分5厘。重修工程始於道光九年（1829）仲夏，至季冬已告完工，道光十年（1830）又增修客堂僧舍。“至是，隘者拓之，崎嶇者曲折平之，天光水影，瑞石交輝，棟壁堅牢，美輪美奐。規模式煥，旁為之翼蓋。至是而朝暉夕陰，氣象一新。”道光乙丑的《重修媽祖閣碑誌》，轉自譚世寶：《金石銘刻的澳門史——明清澳門廟宇碑刻鐘銘集錄研究》，第50—59頁。

同治八年（1869年2月11日─1870年1月30日）1—2月，溫陵泉敬堂再次在媽祖閣正覺禪林內立碑以頌天后聖母之聖德神功，碑仍名《香山濠鏡澳媽祖閣溫陵泉敬堂碑記》，撰碑人為羅定直隸州知州壬子年廣東同考試官及新安縣知縣黃光周。碑文稱：“凡吾泉郡之貿易於澳者，前後共叨惠澤。彼此均沐恩波。今泉敬堂既置業之嘗，為春秋祀典，統計共捐洋銀2318元，非是以答神靈而酬聖德也。”同治七年《香山濠鏡澳媽祖閣溫陵泉敬堂碑記》，轉引自譚世寶：《金石銘刻的澳門史：明清澳門廟宇碑刻鐘銘集錄研究》，第74—78頁。奇怪的是郭永亮《澳門香港之早期關係》第16—18頁及林子升《16—18世紀澳門與中國之關係》第29—30頁均將此碑題為《媽祖閣𤍤興堂碑記》，譚世寶先生已進行了批判，但未指出為什麼會出現這種不可思議的錯誤，是否另有《媽祖閣𤍤興堂碑記》而使郭、林誤錄？如沒有，這種錯誤的來源又在何處，平白無故捏造出一個“𤍤興堂”？俟考。

清道光二十七年（1847年2月15日─1848年2月4日）5—6月，在澳閩潮商人於媽祖閣正覺禪林內立《香山濠鏡澳媽祖閣溫陵泉敬堂碑》，立碑人為溫陵泉敬堂董事王紹雲、陳源和、沈天奎等16 人，撰碑人為廣東提刑按察使督糧道調任雷瓊兵備道黃宗漢。碑文稱：“天后廟者，相傳明時，有一老嫗自閩駕舟一夜至澳，化身於此。閩潮之人商於澳者，為之塐像立廟，並繪船形，勒石紀事。迄今閩之泉漳、粵之潮州飄海市舶，相與禱祈，報賽為會於此。”報導了天后廟創建原始。道光二十七年《香山濠鏡澳媽祖閣溫陵泉敬堂碑記》，轉引自譚世寶：《金石銘刻的澳門史：明清澳門廟宇碑刻鐘銘集錄研究》，第68—70頁。

1988年2月8日，媽閣廟凌晨失火，有200多年歷史的天后大殿全部焚毀。大殿的主樑未被完全燒毀，沒有塌下。供奉在大殿正中央的木製天后娘娘神像，雖被燒焦，但沒有倒下。

崇禎二年（1629年1月24日─1630年2月11日）澳門華商懷、德二街坊眾集資再次重修媽閣廟之神山第一亭。譚世寶：《澳門媽閣廟的歷史考古研究新發現》，載《文化雜誌》第29期，1996年。

1989年2月5日，媽閣廟天后大殿重修落成。

萬曆三十三年（1605年2月18日─1606年2月6日）5—6月，欽差總督廣東珠池市舶稅務兼管鹽法太監李鳳與信官王權、梁宗翰等人主持，由澳門四街華商出資重建媽閣廟“神山第一亭”完成。澳門“四街”即“十字街”，這是一條縱街與一條橫街交叉而成的十字街，被明廷分別命名為“畏字街”、“威字街”、“懷字街”、“德字街”。這十字街本是諸夷建造居住。後多為華商租賃，葡人居樓上，唐人居樓下。媽閣廟神龕“萬曆乙巳四街重修”碑記：“四街重修”，上款為“萬曆乙巳歲”，下款為“仲夏吉日立”，見陳樹榮：《澳門媽祖文化的形成及發展——從媽閣廟石殿神龕“萬曆乙巳四街重修”碑記談起》，載《媽祖文化研究》，第35—53頁；神山第一亭大門石橫樑萬曆乙巳石刻，轉自譚世寶：《金石銘刻的澳門史——明清澳門廟宇碑刻鐘銘集錄研究》，第43頁。釋跡刪：《鹹陟堂詩集》卷13《三巴寺》稱：“相逢十字街頭客，盡是三巴寺里人。”郭棐：《（萬曆）廣東通志》卷69《外志》3《番夷》；譚世寶：《澳門媽閣廟的歷史考古研究新發現》，載《文化雜誌》第29期，1996年。屈大均：《廣東新語》卷2《澳門》；印光任、張汝霖：《澳門記略》卷下《澳蕃篇》稱“其賃於唐人者，皆臨街列肆”；張甄陶：《澳門圖說》（載《小方壺齋輿地叢鈔》第9帙）稱：“其樓房多空曠無居人，賃華人居之。”

媽祖閣（又稱媽閣廟）是一座供奉天后的廟宇。同類型的廟宇，遍佈南中國東南沿海各地。然而，澳門媽祖閣的出衆之處，不僅在於景致的奇麗，香火的鼎盛，尤以其人文的薈萃，身世的不凡，而引人矚目、蜚聲四海。