Em 1648, o Pe. Koffer, S.J., baptiza, na corte dos depostos Ming, a Imperatriz Helena e três filhos, Maria, Ana e Constantino, da família de Yong-Li. Este, então em Shiu-Hing, manda a Macau o mandarim Pang Aquiles com presentes para a Igreja de S. Paulo. Com ele vinham mais dois mandarins que exclamaram ao chegar, perante o espanto chinês: “Nós somos cristãos!”

No dia 10 de Abril de 1690, pelas Bulas Papais Romani Pontificis Pastoralis Solicitudo e Romanus Pontifex Beati Petri de Alexandre VIII, as Dioceses de Pequim e Nanking foram criadas e incluídas no Padroado Português. A Jurisdição da Diocese de Macau foi reorganizada, e D. João de Casal confirmado como seu Bispo. Chegou em 1692 e serviu até morrer, em 1735.

No dia 1 de Setembro de 1940, é erecta a Diocese de Timor (Díli), por iniciativa de D. José da Costa Nunes junto da Santa Sé, pela Bula Solemnibus Conventionibus. Foi-lhe destinada como pastor o Administrante Apostólico Pe. Jaime Garcia Goulart. A Sé Catedral desapareceu com a II Grande Guerra Mundial. (Em 1875 fora separada da Diocese de Malaca e unida à de Macau.)

No dia 20 de Novembro de 1704, o Papa Clemente XI aprova um decreto da Inquisição contra os “Ritos”.

No dia 2 de Novembro de 1854, benção do Campo Santo de S. Miguel Arcanjo pelo Bispo D. Jerónimo da Mata, sendo dois dias depois sepultado o primeiro cadáver (Zenóbia Maria Luísa de Freitas). Antes da construção deste cemitério, os mortos católicos eram enterrados no terreno entre as paredes arruinadas da Igreja de S. Paulo. (Cfr. esta Cronologia…, l852, Outubro, 14).

Em Outubro de 1934, é inaugurada a Escola Infantil D. José da Costa Nunes, com edifício próprio, em terreno vizinho do Jardim da Flora.