崇禎十一年（1638年2月14日─1639年2月2日）重建花王堂。花王堂始建於開埠之初，當時僅搭一草棚木屋而已，後教徒日眾，漸感地狹人擠，遂於本年在1日堂稍東南之處建一石頭壘砌的教堂，堂內設施亦較舊堂完備。故現花王堂正門左邊牆壁的石碑有葡文記錄：Construida ano 1638。郭永亮：《澳門香港之早期關係》第5章，第62頁。

1608年（明萬曆三十六年）香山縣知縣蔡善繼擬訂《制澳十則》。葡人建聖安多尼堂（花王廟）。

清嘉慶十四年（1809年2月14日─1810年2月3日）2月8日，聖安東尼奧堂（花王堂）被大火焚毀。不久，在羅馬天主教徒和非羅馬天主教的基督徒的捐助下，教堂重建。施白蒂：《澳門編年史：19世紀》，第13頁；未亡人編，鄧肇明譯：《馬禮遜回憶錄（全集）》，第134頁載：（2月）8日，今天早上，一間葡萄牙教堂燒了。

古說蕃寺，今稱教堂。建自西人，廟唯崇奉聖母；克配上帝，道還宣頌基督，於是會號耶穌，教名天主，先來東土，沙勿略首滯南頭；遠佈北京，利瑪竇兼傳西藝。徐光啟慕道濠鏡，吳漁山來學澳門，致使禮拜堂興，修道院立，鐘聲則南北環應，廟貌遂東西相望焉。澳城，寺首三巴，堂標十字，玉樓雕鏤。銅像錯磨，可憐一炬阿房，徒賸千秋殘闕，且看門壁，誤認牌坊。至若廟號唐人，堂稱天主。司鐸傳道，闔世廉曾為衆魁；禁寺督封，張汝霖嘗諭夷檄。教經取替，廟自拆除，從此燭捧經翻，難覓當年蠟影，至是殿摧寺毀，徒認今日鴻泥耳！所幸魯殿不獨，陶徑猶存。風信堂留，雪地殿在。龍鬆既圯，銅鐘尚且自鳴；玫瑰仍馨，板障安能阻隔。德而可望，瘋人院雖遷何妨；方以濟各，育嬰堂更拓發展。葛蘭斯寺，留作兵房；羅撒聖堂，毗連女校；大廟舊稱望人寺，古蹟首推花王堂。是皆藉藉有名，斑斑尚在者也。澳門之天主教教堂，首推花王廟為最古，其鼎建年月，已渺不可攷。據耶穌會教士於一五六五年籌建大三巴寺時，其記載稱；“曾在當時簡陋狹小之花王廟內策劃其事”，由是推知，花王廟之創立，當在一五六五年以前，而先於大三巴寺也。花王廟，原名安多尼堂St. Anthony.攷安多尼，迺天主教之聖人，教徒素來奉之為“婚姻主保”，故其廟有花王廟之稱。花王廟在舊日澳城北廓，據《澳門紀略》載稱：“北隅一廟，凡蕃人男女相悅，詣神盟誓畢，僧為卜吉完娶，名曰花王廟。”又云：“佛郎機，婚姻不由媒妁，男女相悅則相耦。父母攜之詣廟跪，僧誦經畢，訊其兩諧，即以兩手攜男女，送之廟門外，謂之交印，廟唯花王。”昔日花王廟之山下為沙欄仔，原屬海濱，澳夷每有乘舟蒞廟交印者。猶憶詩人尤侗有《詠佛郎機人婚俗竹枝詞》云：“蜈蚣舡櫓海中馳，入寺還將紅杖持；何事佛前交印去，定婚來乞比丘尼。”此西洋月姥安多尼，其廟頂塑一聖像，錦袍紅披，手抱一嬰兒，法相莊嚴中，有如送子觀音然，宜其被教徒奉為婚姻主保也！花王廟當一五六五年前後，僅屬一教堂雛型而已。蓋舊日葡人東來拓展殖民地，所至各處，必有天主教傳教士接踵而來者，故澳門亦不能例外。當葡人於一五五七年來澳定居後，天主教教士不久即在現址創立此花王廟。初只搭一小木屋，作為傳道之所。後教徒日衆，漸感地狹人擠，遂由教會於一六三八年（即明末崇禎九年），始正式將其改建，成為一所稍稱完備之教堂。如是經過一百七十餘年，至一八零九年（即嘉慶十四年），一時失慎，竟被焚燬。幸翌年即建回原狀焉。迨至一八七四年九月廿二夜（即同治十三年甲戌八月十二晚），又遭澳門亘古未有之一場大風災，花王廟為雷火燃著，一時火光燭天，照耀沙梨頭及沙欄仔各區。藉其火光，反救了不少水深風烈中之災民，不致履險受溺。因是花王廟整座被毀，又經一年時間，始於一八七五年重修完竣。後教徒遂定每年九月廿二日為天災節，例必扛安多尼神像遊行，作為紀念，至今猶奉行之也。坊間有傳天災節為三巴寺被焚者，實誤耳。試證以現在花王廟門前，尚有一石碑刻載：“建於一六三八年；燬於一八零九年；再建於一八一零年；再毀於一八七四年； 重修於一八七五年。”花王廟實曾經兩次浩劫者也。花生廟溯自創立以來，其鐘樓厥聲洪亮，素為澳中表率，鐘聲一鳴，前後各教堂之大鐘，隨即而應，報時祝禮，醒夢警昏，最為動人者。昔吳歷之《三巴集》記稱：“前山聖堂小鐘打起，各堂大鐘即應。”其詩云：“臘夜如年寒漸短，舊衾欲覆衣還暖，前山後嶺一聲鐘，醒卻送人閒夢斷。”又李遐齡之《勺園詩鈔》亦有詩云：“齊云高閣罷調箏，朱鳥鏘鳴越以清。剛道彈碁誰唤覺，花王廟裡 曙鐘聲。”花王廟自從經過兩次火災，於一八七五年建回後，廟貌自較初時堂皇，一直保持了五十餘年。迄至一九三零年，已覺漸趨殘舊，簷牆剝落，實有再修之必要，迺由澳葡兵頭巴波沙發起，再事重修。經過是次大修後，雖仍保留舊日之本來面貌，而裝飾圖案卻已時代化，直至今焉。花王廟，實迺澳中一間最有歷史性之教堂。當三巴寺於一八三五年被焚時，存在三巴寺中之天主教聖人遺骨，經教徒搶救出來後，初皆供祀於花王廟內，如沙勿略之臂骨等，後來才移奉於三巴仔教堂耳。蓋花王廟已閱盡三百餘年之興替也。