天啟七年（1627年2月16日─1628年2月4日）9月10日，廣東總兵帶管香山寨事祝世爵抓捕私自下澳奸商許佩玉等人，獲走私物品剪絨、綢緞6箱，但隱匿不報，被革職。《明清時期澳門問題檔案文獻彙編》第1冊，第11頁第6號檔《兵部尚書霍維華為廣東總兵帶管香山寨事祝世爵拿獲私澳奸徒隱匿不解應予革任事題稿》。

萬曆三十四年（1606年2月7日─1607年1月27日）5月2日，因當時澳門葡人擅自建築城垣，並聚集海外諸國人在澳門居住，而廣東官府“利其寶貨，佯禁而陰許之”。於是入京參加會試的廣東番禺縣舉人盧廷龍上疏，請求驅逐居住在澳門的葡萄牙人，將他們的居地遷往浪白，並派軍隊鎮守蠔鏡。當時朝廷“以事多窒礙，寢閣不行”。沈德符：《萬曆野獲編》卷30《香山澳》。《明神宗實錄》卷433，萬曆三十五年四月甲辰。

崇禎十三年（1640年1月23日─1641年2月9日）6月22日，劉易斯•帕切科（Luís Paes Pacheco）、桑切斯•帕德雷斯（Rodrigo Sanches de Paredes）、貢薩洛•卡瓦略（Gonçalo Monteiro de Carvalho）及西蒙•擺華（Simão Vaz de Paiva）等4名有日本貿易經驗且在澳門頗有聲望的市民帶著靠典當物件向市民借貸的6000兩白銀的活動經費及40萬兩歸還日本商人的欠款，乘一艘商船離澳赴日。船上共載員74人，其中葡萄牙人61人，黑人13人。7月6日抵達長崎，到埠後即被扣留，船上的大炮也被拆卸。4位使者通過長崎奉行三郎左衛門向幕府將軍遞交了外交備忘錄及相關文書，其文稱：“聞之陛下禁止葡萄牙人入國，我處居民陷於難以筆墨形容之慘境。彼等困窮不能救其妻子，因饑餓而死亡，是為悲慘經驗所明示，在我等出發之前，亦有陷入極度悲哀者，以編成卡斯特羅•布蘭科（D. Francisco de Castelo Branco）船隊，將皇帝禁令與我等苦狀報告西班牙、葡萄牙及印度。同時澳門市主要人物及教會與實業界鉅子召開會議，以為澳門市賴陛下之恩惠，如同赤子受養，是故遵從陛下之命令，自屬當然之事。又西班牙國王陛下違背日本皇帝之意，不予禁止傳教士及其宗教進入日本，乃屬事實。我們又對馬尼拉通知我等之決議。已於（1639年）11月15日由澳門派2人至馬尼拉，馬尼拉方面已下令任何人切勿派神父及其他宗教相關者至日本，違者處以罰金4000兩，不繳納者處以死刑。”而在幕府答覆前，他們即被關進監獄。8月2日，由日本皇帝自江戶派遣之特使2人，即加加爪忠澄（かがつあただすみ）和野野山新兵衛（ののゃましんべぇ）抵達長崎，即時召見葡萄牙人全員及黑奴13人，葡人大喜，以為會受到厚待，誰知日本政府不僅拒不接受葡萄牙人的請求，還將4名澳門使者及57名隨行人員全部處以“有情之死刑”，燒毀葡萄牙商船，僅讓l3名醫師水手僕役乘坐一艘小船返回澳門，轉達日本政府的諭令： 寬永十七年（1640）誅耶穌邪徒諭阿媽港。……阿媽港之蠢蠻，平素尊天主教，欲弘其邪法於本朝。比年所來之船中，或雇唐船，以載耶穌之徒號伴天連者至於此。蓋是以此教唆我里民，竊有覬覦本朝之志。故大君震怒，捕伴天連及其徒，悉斬之磔之，下令禁之。有信其法者，罪及三族。……去歲使節至長崎，諭汝國人，向來必無向於本朝，若有再來，悉戮其舯人，以無孑遺云云。而今背其嚴旨，詐乞和平者，重到於此地。官事無監，制令何變。某等謹奉鈞命，不知其它，不敢赦之。即壞其舟，執其徒若干人，梟首長狥於市，其餘者無少長皆誅之。但船子及醫師者，准彼則其罪輕，且欲令汝國覺知此事，故免其死刑，別造小船放還之。使此狀告於本國也。凡阿媽港近鄰首長聞之者，宜仰本朝之德，以察武威之嚴也。文德泉：《伊納西奧•薩爾明托》（載《文化雜誌》第9期，1992年）一文稱：6000兩白銀從滿清官員手中借貸。村上直次郎原譯，郭輝中譯：《巴達維亞城日記》第2冊，第266—267頁。村上直次郎原譯，郭輝中譯：《巴達維亞城日記》第2冊，第269—270頁；龍思泰：《早期澳門史》第6章，第142—143頁。在這些殉難人員中有2名來自帝汶和索洛的奴隸，他們都是澳門葡萄牙商人的財產。（C. R. Boxer, Francisco Vieira de Figueiredo e os portugueses em Macassar e Timor na época da Restauração 1640—1668，轉自蘇一揚：《澳門與帝汶：殖民管理，貿易與傳教》，載《澳門史新編》第2冊，第604頁。）林復斎：《通航一覧》卷182《南蠻》。

萬曆九年（1581年2月4日─1582年1月23日）蘇格蘭人航海家威廉•卡邁克爾（William Carmichael）從里斯本出發前往果阿，為葡印總督服務了30年，在此期間他訪問了澳門，這是第一位來到中國與澳門的英國人。普加：《英國人初航澳門》，載《澳門史新編》第2冊，第582頁。

萬曆十六年（1588年1月28日─1589年2月14日）11月20日，若奧•伽瑪（D. João Miguel da Gama）在澳門寫信給國王，告知他準備從澳門航行墨西哥前往西班牙的計劃。若奧•伽瑪當時具有航行日本的權利，但到了澳門以後，他出任澳門城防司令，並接受了葡印總督運送船員的命令。Boletim da Filmoteca Ultramarina Portuguesa, No.15, p.554.

崇禎十二年（1639年2月3日─1640年1月22日）7月，由瓦斯科•阿爾梅達（Vasco Palha de Almeida）指揮的4艘澳門槳帆船離澳赴日，途中遇風暴，l艘沉溺，l艘折返澳門，其餘2艘槳帆船載150萬兩銀的貨物於31日抵達長崎，他們遇到了很多阻攔，不准卸貨，不許進行貿易。並接到日本幕府驅逐葡人出境的命令。8月4日，這位幕府代表宣佈了將軍7月5日簽署的命令：禁止葡萄牙人在日本經商。原因是：第一，澳門商船違反了本國禁天主教的敕令，偷運傳教士進入日本；第二，澳門商船為傳教士運送各種供應品；第三，澳門商船走私運來人及錢財，促成了島原叛亂。出於上述理由，你們這些人是該死的。天皇陛下本可公正地處死你們，但皇恩浩蕩，饒你們不死。現特命令你們離開日本，永遠不得返回，以後你們若違背這一命令，必將受到你們現在罪有應得的懲罰。蘇拉馬尼亞姆：《葡萄牙帝國在亞洲：1500—1700政治和經濟史》第6章，第181頁；C. R. Boxer, The Christian Century in Japan, 1549—1650, p. 384.

崇禎六年（1633年2月8日─1634年1月28日）在澳門荷蘭籍商人位於澳門半島西南的新花園發現一塊立於本年的西班牙文碑，碑文稱：“菲利浦四世王朝，蘇沙•賈士度（Souza de Castro）立石於此炮台，1633年。”1580年葡萄牙併入西班牙後，澳門葡萄牙政府並不受西班牙約束。故居澳西班牙人欲以武力使澳葡政府屈服，西班牙人蘇沙•賈士度上尉準備於本年舉事，並打算攻佔大炮台，故預立石於新花園，但此事並未成功。王文達：《澳門掌故》第233頁；Beatriz Basto da Silva, Cronologia da História de Macau, Séculos ⅩⅥ—ⅩⅦ, Vol. l, p. 61.

萬曆三十一年（1603年2月11日─1604年1月30日）7月30日晚，一艘由貢薩洛•索薩船長指揮的從中國前往日本貿易的葡萄牙大黑船在啟航前被韋麻郎率領的兩艘荷蘭商船“伊萊斯姆斯（Erasmus）”號、“奈索（Nassau）”號和一艘中型艦在澳門港乘虛截獲，船上載有1400擔生絲和大量黃金，還有其他貨品。因為當時人們都在岸上忙於出海前的準備工作，船上空無一人。荷蘭人不費吹灰之力就奪得該船。這樣澳門人就先後失去了這兩艘大船的所有資本，每一艘都值1科托（Conto）黃金。他們此時還欠日本人巨額貨款，日本人賒賬把貨物賣給了這兩艘船。澳門耶穌會士在這兩次事故中損失巨大，他們再也無力救濟他人反要靠救濟為生。張天澤：《中葡早期通商史》，第136頁稱荷蘭截獲的這批貨物生絲有2800包，每包價值500盾，總值140萬盾。C.R.Boxer, Fidalgos in the Far East（1550—1770）, p.50.

崇禎三年（1630年2月12日─1631年1月31日）11月11日，葡萄牙船長卡瑪拉•羅郎也（Manuel da Câmara Noronha）以他的劃槳帆船在科欽海岸襲擊和焚燒了擁有20尊大炮的丹麥大黑船。施白蒂：《澳門編年史：16—18世紀》，第38—39頁。